Żeby zakończyć pracę z Modułem dla szkół najlepiej najpierw wylogować się za pomocą ikony Wyloguj się, znajdującej się w górnej części okna, co spowoduje zakończenie połączenia z Serwerem aplikacji Sigma, a dopiero potem należy zamknąć okno przeglądarki internetowej, w której działał Moduł dla szkół. Takie postępowanie minimalizuje ryzyko nieuprawnionego dostępu do danych. Następnie należy wylogować się na stronie głównej Serwera aplikacji Sigma i zamknąć okno przeglądarki internetowej.
Połączenie wygasa automatycznie, jeśli Moduł dla szkół i serwer internetowy przez dłuższy czas nie porozumiewają się ze sobą. Czas ten zwykle wynosi około 20 minut.
Wygaśnięcie połączenia z serwerem powoduje utratę wszystkich informacji, które nie zostały zapisane w bazie danych (tracone są także informacje z pamięci tymczasowej).
Żeby zapobiec utracie danych, należy przed przerwą w pracy (np. przed odejściem od komputera) wykonać operację zapisywania wprowadzonych modyfikacji w bazie danych (karta Zapisz).
Żeby zapobiec wygaśnięciu połączenia, wystarczy co kilka-kilkanaście minut wymusić wymianę informacji pomiędzy Modułem dla szkół a serwerem. Można to zrobić na przykład zapisując dane w pamięci tymczasowej, otwierając inną kartę lub przechodząc do innej pozycji menu.